РРЭЦ был зарегистрирован как национальная автономная некоммерческая организация, согласно федеральному закону Российской Федерации "О некоммерческих организациях" от 12 января 1996 г.
Российский региональный экологический центр (РРЭЦ) действует на основании Устава и Учредительного договора. Договор был подписан, а Устав одобрен учредителями Центра - Европейской комиссией и Российской академией государственной службы при Президенте РФ. Центр расположен в Москве, Российская Федерация. Предполагается также открыть представительства Центра в других регионах России.
Опираясь на положения Устава, РРЭЦ стремится стать независимой, беспристрастной неприбыльной организацией. РРЭЦ создан с целью оказания помощи в решении экологических проблем в Российской Федерации. Центр будет стремиться осуществлять свои задачи путем развития сотрудничества между неправительственными организациями, правительством, предпринимателями, учеными и другими участниками, путем расширения обмена информацией и более широкого привлечения общественности к принятию решений в области охраны окружающей среды.
Руководящим органом Центра является Совет Управляющих, состоящий из 11 человек, которые были назначены, исходя из их личных заслуг, от пяти представительных групп:
правительства Российской Федерации (три управляющих);
предпринимательских кругов (один управляющий);
неправительственных организаций (три управляющих);
академических институтов (два управляющих);
иностранных юридических и физических лиц, которые вносят свою долю в активы Центра (два).
Совет управляющих получает рекомендации от Консультативного Совета, в состав которого должно входить не менее двадцати и не более тридцати членов.
Текущей деятельностью руководит Исполнительный директор.
РРЭЦ представляет из себя общественную организацию международного характера , которая находится вне сферы прямого влияния правительства на способы организации своей деятельности и реализации миссии. Юридический статус РРЭЦ позволяет создать открытую, гибкую и адаптирующуюся структуру, способную разрабатывать различные программы в рамках своих задач. Вместе с тем, с правовой точки зрения РРЭЦ обязан выражать интересы всех вовлеченных сторон: правительства, НПО, предпринимательских кругов и экологических организаций. Центр имеет право выбора любой конкретной проблемы, и может подобрать варианты гибкого или формального сотрудничества с соответствующими международными и национальными, правительственными, неправительственными и частными организациями.